Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnnb1Q02248 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnnb1Q02248 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnnb1Q02248 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnnb1Q02248 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnnb1Q02248 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnnb1Q02248 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnnb1Q02248 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnnb1Q02248 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnnb1Q02248 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnnb1Q02248 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnnb1Q02248 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnnb1Q02248 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnnb1Q02248 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnnb1Q02248 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnnb1Q02248 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnnb1Q02248 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnnb1Q02248 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnnb1Q02248 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnnb1Q02248 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnnb1Q02248 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnnb1Q02248 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnnb1Q02248 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnnb1Q02248 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnnb1Q02248 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnnb1Q02248 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnnb1Q02248 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnnb1Q02248 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnnb1Q02248 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnnb1Q02248 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnnb1Q02248 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnnb1Q02248 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnnb1Q02248 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnnb1Q02248 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnnb1Q02248 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnnb1Q02248 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnnb1Q02248 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnnb1Q02248 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnnb1Q02248 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnnb1Q02248 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnnb1Q02248 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnnb1Q02248 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnnb1Q02248 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnnb1Q02248 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnnb1Q02248 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnnb1Q02248 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnnb1Q02248 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnnb1Q02248 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnnb1Q02248 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnnb1Q02248 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnnb1Q02248 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctnnb1Q02248 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctnnb1Q02248 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctnnb1Q02248 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctnnb1Q02248 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctnnb1Q02248 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctnnb1Q02248 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctnnb1Q02248 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctnnb1Q02248 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctnnb1Q02248 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctnnb1Q02248 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctnnb1Q02248 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctnnb1Q02248 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctnnb1Q02248 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctnnb1Q02248 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctnnb1Q02248 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctnnb1Q02248 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctnnb1Q02248 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctnnb1Q02248 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctnnb1Q02248 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctnnb1Q02248 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctnnb1Q02248 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctnnb1Q02248 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctnnb1Q02248 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctnnb1Q02248 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctnnb1Q02248 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctnnb1Q02248 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctnnb1Q02248 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctnnb1Q02248 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnnb1Q02248 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnnb1Q02248 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnnb1Q02248 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnnb1Q02248 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnnb1Q02248 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnnb1Q02248 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnnb1Q02248 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnnb1Q02248 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnnb1Q02248 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnnb1Q02248 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnnb1Q02248 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnnb1Q02248 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnnb1Q02248 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnnb1Q02248 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnnb1Q02248 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnnb1Q02248 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnnb1Q02248 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnnb1Q02248 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnnb1Q02248 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnnb1Q02248 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnnb1Q02248 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.8 ms