Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrkcqQ02111 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrkcqQ02111 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrkcqQ02111 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrkcqQ02111 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrkcqQ02111 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrkcqQ02111 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrkcqQ02111 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrkcqQ02111 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrkcqQ02111 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PrkcqQ02111 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrkcqQ02111 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrkcqQ02111 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrkcqQ02111 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrkcqQ02111 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrkcqQ02111 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrkcqQ02111 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrkcqQ02111 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrkcqQ02111 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrkcqQ02111 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrkcqQ02111 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrkcqQ02111 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrkcqQ02111 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrkcqQ02111 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrkcqQ02111 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PrkcqQ02111 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PrkcqQ02111 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PrkcqQ02111 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PrkcqQ02111 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PrkcqQ02111 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PrkcqQ02111 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PrkcqQ02111 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PrkcqQ02111 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PrkcqQ02111 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PrkcqQ02111 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms