Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gja5Q01231 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gja5Q01231 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gja5Q01231 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gja5Q01231 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gja5Q01231 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gja5Q01231 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gja5Q01231 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gja5Q01231 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gja5Q01231 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gja5Q01231 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gja5Q01231 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gja5Q01231 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gja5Q01231 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gja5Q01231 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gja5Q01231 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gja5Q01231 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gja5Q01231 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gja5Q01231 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gja5Q01231 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Gja5Q01231 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gja5Q01231 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.91
Gja5Q01231 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gja5Q01231 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Gja5Q01231 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gja5Q01231 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gja5Q01231 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gja5Q01231 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gja5Q01231 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Gja5Q01231 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gja5Q01231 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gja5Q01231 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gja5Q01231 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gja5Q01231 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gja5Q01231 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gja5Q01231 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gja5Q01231 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gja5Q01231 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Gja5Q01231 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gja5Q01231 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gja5Q01231 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gja5Q01231 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gja5Q01231 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gja5Q01231 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gja5Q01231 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gja5Q01231 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gja5Q01231 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gja5Q01231 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gja5Q01231 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Gja5Q01231 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gja5Q01231 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gja5Q01231 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gja5Q01231 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Gja5Q01231 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Gja5Q01231 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gja5Q01231 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gja5Q01231 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gja5Q01231 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gja5Q01231 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gja5Q01231 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gja5Q01231 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gja5Q01231 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gja5Q01231 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gja5Q01231 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gja5Q01231 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gja5Q01231 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Gja5Q01231 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Gja5Q01231 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Gja5Q01231 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Gja5Q01231 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Gja5Q01231 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Gja5Q01231 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Gja5Q01231 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Gja5Q01231 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Gja5Q01231 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Gja5Q01231 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Gja5Q01231 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Gja5Q01231 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Gja5Q01231 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Gja5Q01231 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Gja5Q01231 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Gja5Q01231 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Gja5Q01231 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Gja5Q01231 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gja5Q01231 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gja5Q01231 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gja5Q01231 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gja5Q01231 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gja5Q01231 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gja5Q01231 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gja5Q01231 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gja5Q01231 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gja5Q01231 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gja5Q01231 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gja5Q01231 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gja5Q01231 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gja5Q01231 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gja5Q01231 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gja5Q01231 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gja5Q01231 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms