Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms