Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gjb2Q00977 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gjb2Q00977 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Gjb2Q00977 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gjb2Q00977 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Gjb2Q00977 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Gjb2Q00977 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gjb2Q00977 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gjb2Q00977 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gjb2Q00977 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gjb2Q00977 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gjb2Q00977 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gjb2Q00977 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gjb2Q00977 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gjb2Q00977 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gjb2Q00977 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gjb2Q00977 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gjb2Q00977 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gjb2Q00977 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gjb2Q00977 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gjb2Q00977 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gjb2Q00977 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gjb2Q00977 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gjb2Q00977 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gjb2Q00977 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Gjb2Q00977 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Gjb2Q00977 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Gjb2Q00977 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gjb2Q00977 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gjb2Q00977 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gjb2Q00977 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gjb2Q00977 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gjb2Q00977 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gjb2Q00977 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gjb2Q00977 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gjb2Q00977 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gjb2Q00977 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gjb2Q00977 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gjb2Q00977 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gjb2Q00977 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gjb2Q00977 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gjb2Q00977 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gjb2Q00977 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gjb2Q00977 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gjb2Q00977 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gjb2Q00977 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gjb2Q00977 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gjb2Q00977 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gjb2Q00977 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gjb2Q00977 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gjb2Q00977 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gjb2Q00977 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gjb2Q00977 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gjb2Q00977 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Gjb2Q00977 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Gjb2Q00977 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gjb2Q00977 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gjb2Q00977 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gjb2Q00977 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gjb2Q00977 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gjb2Q00977 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gjb2Q00977 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gjb2Q00977 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gjb2Q00977 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gjb2Q00977 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gjb2Q00977 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gjb2Q00977 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gjb2Q00977 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gjb2Q00977 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gjb2Q00977 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gjb2Q00977 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gjb2Q00977 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gjb2Q00977 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gjb2Q00977 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gjb2Q00977 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gjb2Q00977 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gjb2Q00977 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gjb2Q00977 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gjb2Q00977 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gjb2Q00977 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gjb2Q00977 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gjb2Q00977 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gjb2Q00977 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gjb2Q00977 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gjb2Q00977 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gjb2Q00977 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gjb2Q00977 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gjb2Q00977 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gjb2Q00977 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gjb2Q00977 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gjb2Q00977 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gjb2Q00977 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gjb2Q00977 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gjb2Q00977 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gjb2Q00977 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gjb2Q00977 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gjb2Q00977 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gjb2Q00977 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gjb2Q00977 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gjb2Q00977 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms