Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itga4Q00651 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itga4Q00651 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itga4Q00651 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itga4Q00651 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itga4Q00651 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itga4Q00651 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itga4Q00651 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itga4Q00651 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itga4Q00651 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms