Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gabpb1Q00420 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Gabpb1Q00420 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gabpb1Q00420 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gabpb1Q00420 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gabpb1Q00420 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gabpb1Q00420 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gabpb1Q00420 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gabpb1Q00420 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Gabpb1Q00420 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Gabpb1Q00420 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gabpb1Q00420 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gabpb1Q00420 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gabpb1Q00420 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gabpb1Q00420 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gabpb1Q00420 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gabpb1Q00420 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gabpb1Q00420 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gabpb1Q00420 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gabpb1Q00420 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gabpb1Q00420 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gabpb1Q00420 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gabpb1Q00420 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gabpb1Q00420 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gabpb1Q00420 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gabpb1Q00420 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gabpb1Q00420 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gabpb1Q00420 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Gabpb1Q00420 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gabpb1Q00420 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gabpb1Q00420 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gabpb1Q00420 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gabpb1Q00420 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gabpb1Q00420 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gabpb1Q00420 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gabpb1Q00420 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gabpb1Q00420 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gabpb1Q00420 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gabpb1Q00420 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gabpb1Q00420 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gabpb1Q00420 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gabpb1Q00420 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gabpb1Q00420 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gabpb1Q00420 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gabpb1Q00420 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gabpb1Q00420 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gabpb1Q00420 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gabpb1Q00420 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gabpb1Q00420 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gabpb1Q00420 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gabpb1Q00420 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gabpb1Q00420 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gabpb1Q00420 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gabpb1Q00420 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gabpb1Q00420 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gabpb1Q00420 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gabpb1Q00420 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gabpb1Q00420 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gabpb1Q00420 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gabpb1Q00420 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gabpb1Q00420 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gabpb1Q00420 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gabpb1Q00420 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gabpb1Q00420 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gabpb1Q00420 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gabpb1Q00420 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gabpb1Q00420 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gabpb1Q00420 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gabpb1Q00420 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gabpb1Q00420 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gabpb1Q00420 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gabpb1Q00420 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gabpb1Q00420 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gabpb1Q00420 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gabpb1Q00420 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gabpb1Q00420 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gabpb1Q00420 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gabpb1Q00420 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gabpb1Q00420 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gabpb1Q00420 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gabpb1Q00420 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gabpb1Q00420 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gabpb1Q00420 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gabpb1Q00420 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gabpb1Q00420 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gabpb1Q00420 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Gabpb1Q00420 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gabpb1Q00420 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gabpb1Q00420 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gabpb1Q00420 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gabpb1Q00420 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gabpb1Q00420 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gabpb1Q00420 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gabpb1Q00420 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gabpb1Q00420 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gabpb1Q00420 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gabpb1Q00420 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gabpb1Q00420 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gabpb1Q00420 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gabpb1Q00420 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms