Protein–RNA interactions for Protein: P98083

Shc1, SHC-transforming protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc1P98083 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shc1P98083 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shc1P98083 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shc1P98083 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Shc1P98083 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shc1P98083 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shc1P98083 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shc1P98083 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shc1P98083 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shc1P98083 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shc1P98083 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shc1P98083 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shc1P98083 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shc1P98083 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shc1P98083 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shc1P98083 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shc1P98083 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shc1P98083 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shc1P98083 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shc1P98083 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shc1P98083 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shc1P98083 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shc1P98083 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shc1P98083 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shc1P98083 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shc1P98083 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shc1P98083 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shc1P98083 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shc1P98083 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shc1P98083 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shc1P98083 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shc1P98083 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shc1P98083 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shc1P98083 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shc1P98083 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shc1P98083 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shc1P98083 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shc1P98083 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shc1P98083 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shc1P98083 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Shc1P98083 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shc1P98083 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shc1P98083 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shc1P98083 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Shc1P98083 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shc1P98083 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shc1P98083 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shc1P98083 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shc1P98083 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shc1P98083 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shc1P98083 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shc1P98083 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shc1P98083 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shc1P98083 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shc1P98083 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shc1P98083 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shc1P98083 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shc1P98083 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shc1P98083 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shc1P98083 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shc1P98083 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shc1P98083 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shc1P98083 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shc1P98083 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shc1P98083 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shc1P98083 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Shc1P98083 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shc1P98083 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Shc1P98083 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shc1P98083 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shc1P98083 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shc1P98083 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shc1P98083 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shc1P98083 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shc1P98083 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shc1P98083 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shc1P98083 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shc1P98083 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shc1P98083 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shc1P98083 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shc1P98083 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shc1P98083 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shc1P98083 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shc1P98083 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shc1P98083 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shc1P98083 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shc1P98083 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shc1P98083 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shc1P98083 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shc1P98083 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shc1P98083 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shc1P98083 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shc1P98083 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shc1P98083 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shc1P98083 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Shc1P98083 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shc1P98083 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shc1P98083 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shc1P98083 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shc1P98083 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms