Protein–RNA interactions for Protein: P97801

Smn1, Survival motor neuron protein, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smn1P97801 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smn1P97801 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smn1P97801 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smn1P97801 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smn1P97801 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smn1P97801 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smn1P97801 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms