Protein–RNA interactions for Protein: P97459

Npas1, Neuronal PAS domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 594 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas1P97459 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Npas1P97459 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Npas1P97459 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Npas1P97459 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Npas1P97459 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Npas1P97459 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Npas1P97459 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Npas1P97459 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Npas1P97459 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Npas1P97459 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Npas1P97459 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Npas1P97459 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Npas1P97459 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Npas1P97459 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Npas1P97459 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Npas1P97459 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Npas1P97459 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Npas1P97459 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Npas1P97459 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Npas1P97459 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Npas1P97459 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Npas1P97459 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Npas1P97459 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Npas1P97459 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Npas1P97459 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Npas1P97459 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Npas1P97459 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Npas1P97459 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Npas1P97459 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Npas1P97459 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Npas1P97459 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Npas1P97459 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Npas1P97459 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Npas1P97459 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Npas1P97459 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Npas1P97459 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Npas1P97459 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Npas1P97459 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Npas1P97459 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Npas1P97459 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Npas1P97459 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Npas1P97459 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Npas1P97459 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Npas1P97459 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Npas1P97459 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Npas1P97459 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Npas1P97459 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Npas1P97459 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Npas1P97459 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Npas1P97459 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Npas1P97459 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Npas1P97459 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Npas1P97459 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Npas1P97459 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Npas1P97459 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Npas1P97459 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Npas1P97459 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Npas1P97459 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Npas1P97459 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Npas1P97459 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Npas1P97459 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Npas1P97459 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Npas1P97459 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Npas1P97459 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Npas1P97459 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Npas1P97459 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Npas1P97459 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Npas1P97459 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Npas1P97459 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Npas1P97459 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Npas1P97459 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Npas1P97459 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Npas1P97459 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Npas1P97459 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Npas1P97459 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Npas1P97459 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Npas1P97459 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Npas1P97459 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Npas1P97459 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Npas1P97459 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Npas1P97459 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Npas1P97459 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Npas1P97459 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Npas1P97459 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Npas1P97459 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Npas1P97459 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Npas1P97459 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Npas1P97459 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Npas1P97459 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Npas1P97459 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Npas1P97459 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Npas1P97459 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Npas1P97459 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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