Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nbr1P97432 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nbr1P97432 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nbr1P97432 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nbr1P97432 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nbr1P97432 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nbr1P97432 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nbr1P97432 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nbr1P97432 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nbr1P97432 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nbr1P97432 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nbr1P97432 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nbr1P97432 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Nbr1P97432 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nbr1P97432 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nbr1P97432 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nbr1P97432 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nbr1P97432 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nbr1P97432 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nbr1P97432 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nbr1P97432 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nbr1P97432 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nbr1P97432 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nbr1P97432 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nbr1P97432 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nbr1P97432 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nbr1P97432 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nbr1P97432 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nbr1P97432 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nbr1P97432 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nbr1P97432 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nbr1P97432 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nbr1P97432 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nbr1P97432 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nbr1P97432 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nbr1P97432 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nbr1P97432 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nbr1P97432 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nbr1P97432 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Nbr1P97432 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nbr1P97432 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nbr1P97432 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nbr1P97432 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nbr1P97432 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nbr1P97432 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nbr1P97432 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Nbr1P97432 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nbr1P97432 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nbr1P97432 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nbr1P97432 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nbr1P97432 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Nbr1P97432 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Nbr1P97432 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nbr1P97432 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nbr1P97432 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nbr1P97432 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nbr1P97432 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nbr1P97432 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nbr1P97432 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nbr1P97432 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nbr1P97432 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nbr1P97432 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nbr1P97432 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nbr1P97432 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nbr1P97432 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Nbr1P97432 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nbr1P97432 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Nbr1P97432 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nbr1P97432 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nbr1P97432 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Nbr1P97432 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nbr1P97432 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nbr1P97432 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nbr1P97432 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nbr1P97432 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nbr1P97432 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nbr1P97432 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nbr1P97432 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nbr1P97432 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nbr1P97432 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nbr1P97432 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nbr1P97432 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nbr1P97432 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nbr1P97432 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nbr1P97432 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nbr1P97432 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Nbr1P97432 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nbr1P97432 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nbr1P97432 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nbr1P97432 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nbr1P97432 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Nbr1P97432 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nbr1P97432 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nbr1P97432 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nbr1P97432 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nbr1P97432 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nbr1P97432 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nbr1P97432 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nbr1P97432 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nbr1P97432 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms