Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arf1P84078 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arf1P84078 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arf1P84078 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arf1P84078 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arf1P84078 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arf1P84078 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arf1P84078 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arf1P84078 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arf1P84078 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arf1P84078 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms