Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbx1P82976 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbx1P82976 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbx1P82976 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbx1P82976 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbx1P82976 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbx1P82976 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbx1P82976 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbx1P82976 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbx1P82976 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbx1P82976 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbx1P82976 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbx1P82976 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbx1P82976 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbx1P82976 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbx1P82976 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbx1P82976 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbx1P82976 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbx1P82976 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbx1P82976 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbx1P82976 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbx1P82976 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbx1P82976 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbx1P82976 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbx1P82976 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbx1P82976 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbx1P82976 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbx1P82976 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbx1P82976 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbx1P82976 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbx1P82976 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbx1P82976 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbx1P82976 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbx1P82976 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbx1P82976 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbx1P82976 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbx1P82976 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbx1P82976 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms