Protein–RNA interactions for Protein: P81269

Atf1, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf1P81269 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Atf1P81269 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Atf1P81269 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Atf1P81269 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Atf1P81269 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Atf1P81269 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Atf1P81269 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atf1P81269 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atf1P81269 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atf1P81269 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atf1P81269 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atf1P81269 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atf1P81269 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atf1P81269 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atf1P81269 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atf1P81269 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atf1P81269 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atf1P81269 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Atf1P81269 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Atf1P81269 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atf1P81269 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atf1P81269 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atf1P81269 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atf1P81269 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atf1P81269 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atf1P81269 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atf1P81269 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atf1P81269 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atf1P81269 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atf1P81269 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atf1P81269 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atf1P81269 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Atf1P81269 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atf1P81269 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atf1P81269 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atf1P81269 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atf1P81269 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atf1P81269 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atf1P81269 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Atf1P81269 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atf1P81269 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Atf1P81269 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Atf1P81269 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Atf1P81269 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atf1P81269 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atf1P81269 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atf1P81269 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atf1P81269 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atf1P81269 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atf1P81269 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atf1P81269 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atf1P81269 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atf1P81269 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atf1P81269 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atf1P81269 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atf1P81269 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atf1P81269 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atf1P81269 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atf1P81269 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atf1P81269 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atf1P81269 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atf1P81269 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atf1P81269 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atf1P81269 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atf1P81269 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atf1P81269 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atf1P81269 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atf1P81269 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atf1P81269 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atf1P81269 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atf1P81269 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atf1P81269 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atf1P81269 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atf1P81269 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atf1P81269 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atf1P81269 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atf1P81269 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atf1P81269 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atf1P81269 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atf1P81269 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atf1P81269 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atf1P81269 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Atf1P81269 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atf1P81269 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Atf1P81269 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atf1P81269 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atf1P81269 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atf1P81269 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atf1P81269 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atf1P81269 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atf1P81269 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atf1P81269 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atf1P81269 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atf1P81269 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atf1P81269 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atf1P81269 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atf1P81269 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atf1P81269 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atf1P81269 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atf1P81269 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms