Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otx2P80206 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otx2P80206 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otx2P80206 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otx2P80206 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms