Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smad1P70340 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smad1P70340 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smad1P70340 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smad1P70340 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smad1P70340 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smad1P70340 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smad1P70340 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smad1P70340 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms