Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chl1P70232 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chl1P70232 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chl1P70232 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chl1P70232 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Chl1P70232 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chl1P70232 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chl1P70232 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chl1P70232 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chl1P70232 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chl1P70232 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chl1P70232 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chl1P70232 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chl1P70232 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chl1P70232 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chl1P70232 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chl1P70232 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chl1P70232 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chl1P70232 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chl1P70232 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chl1P70232 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chl1P70232 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chl1P70232 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chl1P70232 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chl1P70232 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chl1P70232 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chl1P70232 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chl1P70232 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chl1P70232 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chl1P70232 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chl1P70232 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chl1P70232 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chl1P70232 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chl1P70232 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Chl1P70232 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Chl1P70232 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Chl1P70232 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Chl1P70232 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Chl1P70232 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Chl1P70232 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chl1P70232 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chl1P70232 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chl1P70232 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chl1P70232 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chl1P70232 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chl1P70232 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Chl1P70232 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Chl1P70232 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Chl1P70232 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Chl1P70232 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Chl1P70232 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chl1P70232 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chl1P70232 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chl1P70232 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chl1P70232 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chl1P70232 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chl1P70232 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chl1P70232 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Chl1P70232 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chl1P70232 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chl1P70232 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chl1P70232 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chl1P70232 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chl1P70232 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chl1P70232 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chl1P70232 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chl1P70232 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chl1P70232 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chl1P70232 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chl1P70232 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chl1P70232 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chl1P70232 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chl1P70232 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Chl1P70232 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chl1P70232 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chl1P70232 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chl1P70232 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chl1P70232 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chl1P70232 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chl1P70232 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chl1P70232 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chl1P70232 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chl1P70232 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chl1P70232 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chl1P70232 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chl1P70232 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chl1P70232 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chl1P70232 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chl1P70232 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chl1P70232 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chl1P70232 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chl1P70232 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Chl1P70232 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chl1P70232 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chl1P70232 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chl1P70232 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chl1P70232 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chl1P70232 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chl1P70232 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chl1P70232 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms