Protein–RNA interactions for Protein: P62858

Rps28, 40S ribosomal protein S28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps28P62858 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rps28P62858 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rps28P62858 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rps28P62858 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rps28P62858 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms