Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rps29P62274 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rps29P62274 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Rps29P62274 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Rps29P62274 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Rps29P62274 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
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