Protein–RNA interactions for Protein: P61460

Depdc5, GATOR complex protein DEPDC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depdc5P61460 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Depdc5P61460 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Depdc5P61460 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Depdc5P61460 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Depdc5P61460 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Depdc5P61460 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Depdc5P61460 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Depdc5P61460 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Depdc5P61460 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Depdc5P61460 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Depdc5P61460 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Depdc5P61460 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Depdc5P61460 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Depdc5P61460 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Depdc5P61460 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Depdc5P61460 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Depdc5P61460 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Depdc5P61460 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Depdc5P61460 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Depdc5P61460 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Depdc5P61460 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Depdc5P61460 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Depdc5P61460 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Depdc5P61460 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Depdc5P61460 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Depdc5P61460 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Depdc5P61460 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Depdc5P61460 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Depdc5P61460 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Depdc5P61460 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Depdc5P61460 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Depdc5P61460 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Depdc5P61460 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Depdc5P61460 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Depdc5P61460 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Depdc5P61460 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Depdc5P61460 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Depdc5P61460 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Depdc5P61460 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Depdc5P61460 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Depdc5P61460 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Depdc5P61460 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Depdc5P61460 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Depdc5P61460 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Depdc5P61460 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Depdc5P61460 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Depdc5P61460 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Depdc5P61460 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Depdc5P61460 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Depdc5P61460 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Depdc5P61460 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Depdc5P61460 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Depdc5P61460 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Depdc5P61460 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Depdc5P61460 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Depdc5P61460 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Depdc5P61460 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Depdc5P61460 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Depdc5P61460 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Depdc5P61460 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Depdc5P61460 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Depdc5P61460 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Depdc5P61460 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Depdc5P61460 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Depdc5P61460 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Depdc5P61460 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Depdc5P61460 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Depdc5P61460 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Depdc5P61460 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Depdc5P61460 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Depdc5P61460 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Depdc5P61460 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Depdc5P61460 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Depdc5P61460 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Depdc5P61460 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Depdc5P61460 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Depdc5P61460 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Depdc5P61460 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Depdc5P61460 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Depdc5P61460 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Depdc5P61460 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Depdc5P61460 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Depdc5P61460 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Depdc5P61460 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Depdc5P61460 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Depdc5P61460 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Depdc5P61460 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Depdc5P61460 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Depdc5P61460 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Depdc5P61460 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Depdc5P61460 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Depdc5P61460 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Depdc5P61460 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Depdc5P61460 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Depdc5P61460 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Depdc5P61460 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Depdc5P61460 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Depdc5P61460 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Depdc5P61460 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Depdc5P61460 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 157.8 ms