Protein–RNA interactions for Protein: P61211

Arl1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl1P61211 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arl1P61211 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arl1P61211 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arl1P61211 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arl1P61211 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Arl1P61211 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arl1P61211 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arl1P61211 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arl1P61211 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arl1P61211 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arl1P61211 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arl1P61211 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arl1P61211 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arl1P61211 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arl1P61211 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Arl1P61211 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Arl1P61211 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Arl1P61211 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Arl1P61211 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arl1P61211 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arl1P61211 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arl1P61211 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arl1P61211 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arl1P61211 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arl1P61211 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arl1P61211 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arl1P61211 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arl1P61211 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arl1P61211 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arl1P61211 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arl1P61211 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arl1P61211 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arl1P61211 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arl1P61211 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arl1P61211 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arl1P61211 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arl1P61211 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arl1P61211 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Arl1P61211 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Arl1P61211 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arl1P61211 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arl1P61211 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arl1P61211 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arl1P61211 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arl1P61211 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arl1P61211 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arl1P61211 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arl1P61211 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arl1P61211 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arl1P61211 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arl1P61211 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arl1P61211 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arl1P61211 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arl1P61211 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arl1P61211 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arl1P61211 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arl1P61211 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arl1P61211 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Arl1P61211 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arl1P61211 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arl1P61211 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arl1P61211 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arl1P61211 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arl1P61211 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arl1P61211 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arl1P61211 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arl1P61211 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arl1P61211 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arl1P61211 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arl1P61211 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arl1P61211 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arl1P61211 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arl1P61211 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arl1P61211 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arl1P61211 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arl1P61211 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arl1P61211 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Arl1P61211 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arl1P61211 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arl1P61211 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arl1P61211 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arl1P61211 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arl1P61211 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arl1P61211 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arl1P61211 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arl1P61211 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arl1P61211 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arl1P61211 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arl1P61211 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arl1P61211 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arl1P61211 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arl1P61211 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arl1P61211 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arl1P61211 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arl1P61211 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arl1P61211 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arl1P61211 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arl1P61211 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Arl1P61211 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arl1P61211 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms