Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Snap25P60879 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Snap25P60879 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Snap25P60879 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Snap25P60879 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Snap25P60879 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Snap25P60879 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Snap25P60879 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Snap25P60879 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Snap25P60879 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Snap25P60879 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Snap25P60879 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Snap25P60879 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Snap25P60879 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Snap25P60879 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Snap25P60879 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Snap25P60879 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Snap25P60879 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Snap25P60879 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Snap25P60879 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Snap25P60879 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Snap25P60879 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Snap25P60879 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Snap25P60879 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Snap25P60879 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Snap25P60879 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Snap25P60879 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Snap25P60879 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Snap25P60879 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Snap25P60879 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Snap25P60879 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Snap25P60879 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Snap25P60879 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Snap25P60879 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Snap25P60879 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Snap25P60879 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Snap25P60879 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Snap25P60879 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Snap25P60879 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Snap25P60879 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Snap25P60879 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Snap25P60879 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Snap25P60879 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Snap25P60879 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Snap25P60879 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Snap25P60879 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Snap25P60879 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Snap25P60879 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Snap25P60879 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Snap25P60879 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Snap25P60879 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Snap25P60879 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Snap25P60879 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Snap25P60879 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Snap25P60879 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Snap25P60879 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Snap25P60879 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Snap25P60879 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Snap25P60879 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Snap25P60879 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Snap25P60879 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Snap25P60879 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Snap25P60879 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Snap25P60879 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Snap25P60879 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Snap25P60879 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Snap25P60879 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Snap25P60879 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Snap25P60879 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Snap25P60879 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Snap25P60879 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Snap25P60879 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Snap25P60879 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Snap25P60879 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Snap25P60879 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Snap25P60879 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Snap25P60879 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Snap25P60879 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Snap25P60879 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Snap25P60879 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Snap25P60879 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Snap25P60879 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Snap25P60879 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Snap25P60879 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Snap25P60879 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Snap25P60879 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Snap25P60879 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Snap25P60879 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Snap25P60879 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Snap25P60879 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Snap25P60879 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Snap25P60879 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Snap25P60879 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Snap25P60879 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Snap25P60879 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Snap25P60879 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Snap25P60879 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Snap25P60879 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Snap25P60879 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Snap25P60879 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms