Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P58686 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P58686 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P58686 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P58686 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P58686 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P58686 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P58686 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P58686 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P58686 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P58686 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P58686 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P58686 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P58686 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P58686 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P58686 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P58686 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P58686 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P58686 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P58686 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P58686 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P58686 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P58686 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P58686 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P58686 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P58686 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P58686 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P58686 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P58686 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P58686 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P58686 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P58686 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P58686 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P58686 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P58686 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P58686 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P58686 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P58686 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P58686 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
P58686 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P58686 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P58686 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P58686 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P58686 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P58686 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P58686 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P58686 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P58686 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
P58686 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P58686 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P58686 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P58686 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P58686 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P58686 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
P58686 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P58686 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P58686 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P58686 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P58686 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P58686 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P58686 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P58686 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P58686 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P58686 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P58686 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P58686 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P58686 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P58686 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P58686 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P58686 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P58686 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P58686 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P58686 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P58686 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P58686 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P58686 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P58686 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P58686 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P58686 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P58686 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P58686 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P58686 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P58686 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P58686 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P58686 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
P58686 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P58686 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P58686 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P58686 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P58686 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P58686 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P58686 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P58686 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P58686 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P58686 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P58686 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P58686 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P58686 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P58686 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P58686 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms