Protein–RNA interactions for Protein: P56481

Cckbr, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckbrP56481 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CckbrP56481 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CckbrP56481 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CckbrP56481 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CckbrP56481 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CckbrP56481 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CckbrP56481 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
CckbrP56481 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
CckbrP56481 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CckbrP56481 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CckbrP56481 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CckbrP56481 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CckbrP56481 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CckbrP56481 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CckbrP56481 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CckbrP56481 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CckbrP56481 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CckbrP56481 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CckbrP56481 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CckbrP56481 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CckbrP56481 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CckbrP56481 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CckbrP56481 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CckbrP56481 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CckbrP56481 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CckbrP56481 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CckbrP56481 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CckbrP56481 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CckbrP56481 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CckbrP56481 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CckbrP56481 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CckbrP56481 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms