Protein–RNA interactions for Protein: P55258

Rab8a, Ras-related protein Rab-8A, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab8aP55258 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms