Protein–RNA interactions for Protein: P54728

Rad23b, UV excision repair protein RAD23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23bP54728 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Rad23bP54728 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rad23bP54728 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Rad23bP54728 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rad23bP54728 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rad23bP54728 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rad23bP54728 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rad23bP54728 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rad23bP54728 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Rad23bP54728 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rad23bP54728 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Rad23bP54728 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rad23bP54728 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rad23bP54728 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rad23bP54728 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rad23bP54728 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rad23bP54728 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Rad23bP54728 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rad23bP54728 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rad23bP54728 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rad23bP54728 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rad23bP54728 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rad23bP54728 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rad23bP54728 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rad23bP54728 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rad23bP54728 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rad23bP54728 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rad23bP54728 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rad23bP54728 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Rad23bP54728 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rad23bP54728 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rad23bP54728 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Rad23bP54728 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Rad23bP54728 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Rad23bP54728 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Rad23bP54728 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rad23bP54728 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rad23bP54728 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rad23bP54728 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rad23bP54728 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rad23bP54728 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rad23bP54728 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rad23bP54728 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rad23bP54728 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Rad23bP54728 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rad23bP54728 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rad23bP54728 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Rad23bP54728 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Rad23bP54728 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rad23bP54728 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Rad23bP54728 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Rad23bP54728 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rad23bP54728 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rad23bP54728 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rad23bP54728 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rad23bP54728 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rad23bP54728 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rad23bP54728 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rad23bP54728 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rad23bP54728 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rad23bP54728 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rad23bP54728 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rad23bP54728 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rad23bP54728 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rad23bP54728 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rad23bP54728 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rad23bP54728 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Rad23bP54728 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rad23bP54728 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rad23bP54728 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
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