Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rad23aP54726 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rad23aP54726 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Rad23aP54726 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rad23aP54726 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rad23aP54726 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rad23aP54726 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rad23aP54726 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rad23aP54726 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rad23aP54726 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rad23aP54726 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rad23aP54726 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rad23aP54726 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rad23aP54726 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rad23aP54726 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rad23aP54726 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rad23aP54726 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rad23aP54726 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rad23aP54726 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rad23aP54726 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rad23aP54726 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rad23aP54726 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Rad23aP54726 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rad23aP54726 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rad23aP54726 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rad23aP54726 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rad23aP54726 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rad23aP54726 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rad23aP54726 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rad23aP54726 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rad23aP54726 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rad23aP54726 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rad23aP54726 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rad23aP54726 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rad23aP54726 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rad23aP54726 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rad23aP54726 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rad23aP54726 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Rad23aP54726 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rad23aP54726 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Rad23aP54726 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rad23aP54726 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rad23aP54726 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rad23aP54726 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rad23aP54726 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rad23aP54726 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rad23aP54726 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rad23aP54726 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rad23aP54726 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rad23aP54726 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rad23aP54726 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rad23aP54726 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rad23aP54726 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rad23aP54726 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rad23aP54726 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Rad23aP54726 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Rad23aP54726 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Rad23aP54726 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rad23aP54726 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Rad23aP54726 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rad23aP54726 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rad23aP54726 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rad23aP54726 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rad23aP54726 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rad23aP54726 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rad23aP54726 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rad23aP54726 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rad23aP54726 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rad23aP54726 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rad23aP54726 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rad23aP54726 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Rad23aP54726 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rad23aP54726 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rad23aP54726 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rad23aP54726 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Rad23aP54726 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rad23aP54726 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rad23aP54726 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rad23aP54726 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rad23aP54726 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rad23aP54726 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rad23aP54726 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rad23aP54726 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rad23aP54726 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rad23aP54726 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rad23aP54726 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rad23aP54726 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rad23aP54726 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rad23aP54726 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rad23aP54726 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rad23aP54726 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rad23aP54726 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rad23aP54726 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rad23aP54726 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rad23aP54726 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rad23aP54726 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rad23aP54726 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rad23aP54726 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rad23aP54726 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rad23aP54726 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms