Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PctpP53808 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PctpP53808 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PctpP53808 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PctpP53808 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PctpP53808 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PctpP53808 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PctpP53808 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PctpP53808 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PctpP53808 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PctpP53808 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PctpP53808 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PctpP53808 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PctpP53808 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PctpP53808 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PctpP53808 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PctpP53808 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PctpP53808 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PctpP53808 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PctpP53808 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PctpP53808 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PctpP53808 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PctpP53808 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PctpP53808 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PctpP53808 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PctpP53808 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PctpP53808 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PctpP53808 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PctpP53808 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PctpP53808 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PctpP53808 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PctpP53808 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PctpP53808 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PctpP53808 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PctpP53808 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PctpP53808 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PctpP53808 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PctpP53808 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PctpP53808 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.3
PctpP53808 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
PctpP53808 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PctpP53808 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PctpP53808 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PctpP53808 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PctpP53808 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PctpP53808 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PctpP53808 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PctpP53808 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PctpP53808 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PctpP53808 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PctpP53808 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PctpP53808 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PctpP53808 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PctpP53808 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PctpP53808 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PctpP53808 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PctpP53808 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PctpP53808 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PctpP53808 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PctpP53808 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PctpP53808 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PctpP53808 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PctpP53808 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PctpP53808 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PctpP53808 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PctpP53808 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PctpP53808 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PctpP53808 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PctpP53808 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PctpP53808 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PctpP53808 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PctpP53808 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PctpP53808 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PctpP53808 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PctpP53808 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PctpP53808 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PctpP53808 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PctpP53808 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PctpP53808 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PctpP53808 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PctpP53808 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PctpP53808 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PctpP53808 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PctpP53808 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PctpP53808 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PctpP53808 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PctpP53808 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PctpP53808 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PctpP53808 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PctpP53808 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PctpP53808 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PctpP53808 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PctpP53808 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PctpP53808 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PctpP53808 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PctpP53808 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PctpP53808 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PctpP53808 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PctpP53808 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PctpP53808 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms