Protein–RNA interactions for Protein: P53798

Fdft1, Squalene synthase, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fdft1P53798 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms