Protein–RNA interactions for Protein: P52432

Polr1c, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1cP52432 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr1cP52432 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr1cP52432 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr1cP52432 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr1cP52432 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr1cP52432 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr1cP52432 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr1cP52432 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr1cP52432 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr1cP52432 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr1cP52432 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr1cP52432 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr1cP52432 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr1cP52432 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr1cP52432 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr1cP52432 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr1cP52432 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr1cP52432 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr1cP52432 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr1cP52432 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr1cP52432 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr1cP52432 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr1cP52432 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr1cP52432 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr1cP52432 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr1cP52432 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr1cP52432 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr1cP52432 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr1cP52432 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr1cP52432 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr1cP52432 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr1cP52432 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr1cP52432 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr1cP52432 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr1cP52432 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr1cP52432 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr1cP52432 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr1cP52432 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr1cP52432 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr1cP52432 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr1cP52432 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr1cP52432 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr1cP52432 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr1cP52432 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr1cP52432 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr1cP52432 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr1cP52432 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr1cP52432 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr1cP52432 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr1cP52432 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr1cP52432 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr1cP52432 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr1cP52432 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr1cP52432 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr1cP52432 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr1cP52432 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr1cP52432 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr1cP52432 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr1cP52432 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr1cP52432 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr1cP52432 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr1cP52432 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr1cP52432 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr1cP52432 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr1cP52432 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr1cP52432 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr1cP52432 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr1cP52432 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr1cP52432 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr1cP52432 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr1cP52432 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr1cP52432 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr1cP52432 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr1cP52432 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr1cP52432 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr1cP52432 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr1cP52432 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr1cP52432 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr1cP52432 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr1cP52432 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr1cP52432 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr1cP52432 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr1cP52432 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr1cP52432 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr1cP52432 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr1cP52432 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr1cP52432 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr1cP52432 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr1cP52432 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr1cP52432 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr1cP52432 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr1cP52432 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr1cP52432 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr1cP52432 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr1cP52432 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr1cP52432 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr1cP52432 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr1cP52432 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr1cP52432 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr1cP52432 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms