Protein–RNA interactions for Protein: P51655

Gpc4, Glypican-4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc4P51655 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gpc4P51655 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gpc4P51655 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gpc4P51655 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gpc4P51655 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gpc4P51655 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gpc4P51655 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gpc4P51655 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gpc4P51655 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gpc4P51655 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gpc4P51655 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gpc4P51655 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gpc4P51655 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gpc4P51655 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gpc4P51655 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gpc4P51655 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gpc4P51655 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gpc4P51655 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gpc4P51655 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gpc4P51655 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gpc4P51655 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gpc4P51655 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gpc4P51655 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gpc4P51655 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gpc4P51655 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gpc4P51655 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gpc4P51655 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gpc4P51655 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gpc4P51655 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gpc4P51655 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gpc4P51655 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gpc4P51655 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gpc4P51655 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gpc4P51655 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gpc4P51655 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gpc4P51655 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gpc4P51655 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gpc4P51655 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gpc4P51655 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gpc4P51655 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gpc4P51655 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gpc4P51655 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gpc4P51655 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gpc4P51655 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gpc4P51655 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gpc4P51655 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gpc4P51655 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gpc4P51655 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gpc4P51655 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gpc4P51655 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gpc4P51655 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gpc4P51655 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gpc4P51655 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gpc4P51655 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gpc4P51655 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gpc4P51655 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gpc4P51655 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gpc4P51655 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gpc4P51655 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gpc4P51655 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gpc4P51655 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gpc4P51655 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gpc4P51655 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gpc4P51655 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gpc4P51655 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gpc4P51655 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gpc4P51655 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gpc4P51655 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gpc4P51655 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gpc4P51655 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gpc4P51655 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gpc4P51655 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gpc4P51655 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gpc4P51655 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gpc4P51655 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gpc4P51655 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gpc4P51655 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gpc4P51655 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gpc4P51655 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gpc4P51655 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gpc4P51655 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gpc4P51655 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gpc4P51655 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gpc4P51655 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gpc4P51655 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gpc4P51655 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gpc4P51655 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gpc4P51655 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gpc4P51655 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Gpc4P51655 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gpc4P51655 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gpc4P51655 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Gpc4P51655 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gpc4P51655 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gpc4P51655 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gpc4P51655 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gpc4P51655 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gpc4P51655 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gpc4P51655 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gpc4P51655 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms