Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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Tmod1P49813 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmod1P49813 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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Tmod1P49813 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
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Tmod1P49813 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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Tmod1P49813 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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Tmod1P49813 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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Tmod1P49813 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmod1P49813 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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Tmod1P49813 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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Tmod1P49813 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmod1P49813 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tmod1P49813 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
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Tmod1P49813 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
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Tmod1P49813 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tmod1P49813 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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Tmod1P49813 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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Tmod1P49813 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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Tmod1P49813 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmod1P49813 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmod1P49813 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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Tmod1P49813 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmod1P49813 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmod1P49813 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmod1P49813 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmod1P49813 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmod1P49813 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmod1P49813 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmod1P49813 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmod1P49813 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmod1P49813 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmod1P49813 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmod1P49813 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmod1P49813 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmod1P49813 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmod1P49813 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmod1P49813 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
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Tmod1P49813 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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