Protein–RNA interactions for Protein: P49429

Hpd, 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HpdP49429 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HpdP49429 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HpdP49429 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HpdP49429 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HpdP49429 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HpdP49429 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HpdP49429 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HpdP49429 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HpdP49429 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HpdP49429 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HpdP49429 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HpdP49429 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HpdP49429 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HpdP49429 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HpdP49429 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HpdP49429 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HpdP49429 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HpdP49429 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HpdP49429 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HpdP49429 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HpdP49429 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HpdP49429 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HpdP49429 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
HpdP49429 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HpdP49429 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HpdP49429 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HpdP49429 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HpdP49429 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HpdP49429 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HpdP49429 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HpdP49429 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HpdP49429 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HpdP49429 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HpdP49429 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HpdP49429 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HpdP49429 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HpdP49429 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HpdP49429 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HpdP49429 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HpdP49429 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HpdP49429 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HpdP49429 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HpdP49429 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HpdP49429 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HpdP49429 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HpdP49429 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HpdP49429 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HpdP49429 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HpdP49429 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HpdP49429 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HpdP49429 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HpdP49429 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HpdP49429 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HpdP49429 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HpdP49429 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HpdP49429 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HpdP49429 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HpdP49429 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HpdP49429 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HpdP49429 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HpdP49429 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HpdP49429 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HpdP49429 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HpdP49429 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HpdP49429 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HpdP49429 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HpdP49429 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HpdP49429 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HpdP49429 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HpdP49429 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HpdP49429 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HpdP49429 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HpdP49429 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HpdP49429 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HpdP49429 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HpdP49429 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HpdP49429 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HpdP49429 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HpdP49429 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HpdP49429 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HpdP49429 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HpdP49429 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HpdP49429 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HpdP49429 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HpdP49429 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HpdP49429 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HpdP49429 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HpdP49429 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HpdP49429 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HpdP49429 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HpdP49429 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HpdP49429 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HpdP49429 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HpdP49429 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HpdP49429 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HpdP49429 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HpdP49429 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HpdP49429 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HpdP49429 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HpdP49429 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms