Protein–RNA interactions for Protein: P48437

Prox1, Prospero homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox1P48437 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Prox1P48437 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Prox1P48437 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Prox1P48437 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Prox1P48437 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Prox1P48437 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Prox1P48437 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Prox1P48437 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prox1P48437 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prox1P48437 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prox1P48437 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prox1P48437 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prox1P48437 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prox1P48437 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prox1P48437 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms