Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbx2P48031 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms