Protein–RNA interactions for Protein: P47963

Rpl13, 60S ribosomal protein L13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13P47963 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rpl13P47963 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rpl13P47963 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rpl13P47963 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rpl13P47963 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rpl13P47963 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rpl13P47963 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpl13P47963 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpl13P47963 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpl13P47963 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpl13P47963 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpl13P47963 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpl13P47963 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpl13P47963 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpl13P47963 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpl13P47963 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpl13P47963 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpl13P47963 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpl13P47963 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpl13P47963 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpl13P47963 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpl13P47963 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpl13P47963 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpl13P47963 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpl13P47963 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpl13P47963 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpl13P47963 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpl13P47963 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpl13P47963 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpl13P47963 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpl13P47963 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpl13P47963 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpl13P47963 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpl13P47963 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpl13P47963 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rpl13P47963 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rpl13P47963 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rpl13P47963 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rpl13P47963 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rpl13P47963 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rpl13P47963 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rpl13P47963 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rpl13P47963 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rpl13P47963 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rpl13P47963 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rpl13P47963 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rpl13P47963 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rpl13P47963 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rpl13P47963 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rpl13P47963 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rpl13P47963 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rpl13P47963 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rpl13P47963 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rpl13P47963 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rpl13P47963 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rpl13P47963 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rpl13P47963 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rpl13P47963 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rpl13P47963 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rpl13P47963 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rpl13P47963 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rpl13P47963 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rpl13P47963 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rpl13P47963 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rpl13P47963 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rpl13P47963 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rpl13P47963 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rpl13P47963 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rpl13P47963 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rpl13P47963 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rpl13P47963 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rpl13P47963 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Rpl13P47963 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rpl13P47963 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rpl13P47963 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rpl13P47963 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rpl13P47963 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rpl13P47963 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rpl13P47963 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rpl13P47963 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rpl13P47963 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rpl13P47963 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rpl13P47963 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rpl13P47963 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rpl13P47963 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rpl13P47963 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rpl13P47963 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rpl13P47963 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rpl13P47963 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rpl13P47963 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rpl13P47963 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rpl13P47963 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Rpl13P47963 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rpl13P47963 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rpl13P47963 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rpl13P47963 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rpl13P47963 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rpl13P47963 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rpl13P47963 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rpl13P47963 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms