Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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