Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TfamP40630 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TfamP40630 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TfamP40630 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TfamP40630 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TfamP40630 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TfamP40630 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TfamP40630 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TfamP40630 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TfamP40630 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TfamP40630 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TfamP40630 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TfamP40630 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TfamP40630 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TfamP40630 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TfamP40630 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TfamP40630 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TfamP40630 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TfamP40630 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TfamP40630 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TfamP40630 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TfamP40630 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TfamP40630 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TfamP40630 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TfamP40630 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TfamP40630 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TfamP40630 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TfamP40630 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TfamP40630 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TfamP40630 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TfamP40630 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TfamP40630 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TfamP40630 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TfamP40630 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TfamP40630 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TfamP40630 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TfamP40630 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TfamP40630 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TfamP40630 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TfamP40630 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TfamP40630 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TfamP40630 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TfamP40630 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TfamP40630 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TfamP40630 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TfamP40630 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TfamP40630 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TfamP40630 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TfamP40630 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TfamP40630 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TfamP40630 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TfamP40630 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TfamP40630 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TfamP40630 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TfamP40630 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TfamP40630 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TfamP40630 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TfamP40630 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TfamP40630 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TfamP40630 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TfamP40630 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TfamP40630 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TfamP40630 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TfamP40630 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TfamP40630 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TfamP40630 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TfamP40630 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TfamP40630 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TfamP40630 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TfamP40630 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TfamP40630 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TfamP40630 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TfamP40630 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TfamP40630 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TfamP40630 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TfamP40630 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TfamP40630 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TfamP40630 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TfamP40630 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TfamP40630 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TfamP40630 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TfamP40630 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TfamP40630 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TfamP40630 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TfamP40630 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TfamP40630 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TfamP40630 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TfamP40630 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TfamP40630 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TfamP40630 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TfamP40630 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TfamP40630 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TfamP40630 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TfamP40630 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TfamP40630 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TfamP40630 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TfamP40630 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TfamP40630 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TfamP40630 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TfamP40630 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms