Protein–RNA interactions for Protein: P35821

Ptpn1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn1P35821 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ptpn1P35821 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ptpn1P35821 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ptpn1P35821 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ptpn1P35821 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ptpn1P35821 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ptpn1P35821 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ptpn1P35821 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ptpn1P35821 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ptpn1P35821 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ptpn1P35821 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ptpn1P35821 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ptpn1P35821 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptpn1P35821 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptpn1P35821 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptpn1P35821 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptpn1P35821 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptpn1P35821 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptpn1P35821 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptpn1P35821 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptpn1P35821 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptpn1P35821 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptpn1P35821 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptpn1P35821 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptpn1P35821 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptpn1P35821 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptpn1P35821 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptpn1P35821 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptpn1P35821 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptpn1P35821 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptpn1P35821 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptpn1P35821 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptpn1P35821 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptpn1P35821 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptpn1P35821 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptpn1P35821 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptpn1P35821 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptpn1P35821 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptpn1P35821 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptpn1P35821 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptpn1P35821 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptpn1P35821 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptpn1P35821 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptpn1P35821 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptpn1P35821 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptpn1P35821 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptpn1P35821 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptpn1P35821 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptpn1P35821 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptpn1P35821 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptpn1P35821 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptpn1P35821 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptpn1P35821 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptpn1P35821 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptpn1P35821 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptpn1P35821 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ptpn1P35821 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ptpn1P35821 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ptpn1P35821 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ptpn1P35821 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ptpn1P35821 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ptpn1P35821 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ptpn1P35821 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ptpn1P35821 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ptpn1P35821 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ptpn1P35821 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ptpn1P35821 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ptpn1P35821 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ptpn1P35821 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ptpn1P35821 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptpn1P35821 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptpn1P35821 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptpn1P35821 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptpn1P35821 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptpn1P35821 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptpn1P35821 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptpn1P35821 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptpn1P35821 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptpn1P35821 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptpn1P35821 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptpn1P35821 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptpn1P35821 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptpn1P35821 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptpn1P35821 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptpn1P35821 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptpn1P35821 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptpn1P35821 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptpn1P35821 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptpn1P35821 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptpn1P35821 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptpn1P35821 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptpn1P35821 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptpn1P35821 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptpn1P35821 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptpn1P35821 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptpn1P35821 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptpn1P35821 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptpn1P35821 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptpn1P35821 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptpn1P35821 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms