Protein–RNA interactions for Protein: P35460

Ly6f, Lymphocyte antigen 6F, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6fP35460 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ly6fP35460 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ly6fP35460 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ly6fP35460 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ly6fP35460 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ly6fP35460 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ly6fP35460 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ly6fP35460 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ly6fP35460 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ly6fP35460 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ly6fP35460 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ly6fP35460 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ly6fP35460 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ly6fP35460 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ly6fP35460 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ly6fP35460 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ly6fP35460 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ly6fP35460 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ly6fP35460 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ly6fP35460 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ly6fP35460 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ly6fP35460 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ly6fP35460 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ly6fP35460 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ly6fP35460 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ly6fP35460 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ly6fP35460 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ly6fP35460 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ly6fP35460 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ly6fP35460 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ly6fP35460 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ly6fP35460 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ly6fP35460 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ly6fP35460 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ly6fP35460 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ly6fP35460 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ly6fP35460 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ly6fP35460 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ly6fP35460 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ly6fP35460 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ly6fP35460 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ly6fP35460 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ly6fP35460 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ly6fP35460 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ly6fP35460 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ly6fP35460 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ly6fP35460 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ly6fP35460 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ly6fP35460 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ly6fP35460 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ly6fP35460 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ly6fP35460 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ly6fP35460 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ly6fP35460 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ly6fP35460 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ly6fP35460 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ly6fP35460 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ly6fP35460 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ly6fP35460 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ly6fP35460 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ly6fP35460 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ly6fP35460 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ly6fP35460 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ly6fP35460 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ly6fP35460 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ly6fP35460 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ly6fP35460 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ly6fP35460 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ly6fP35460 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ly6fP35460 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ly6fP35460 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ly6fP35460 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ly6fP35460 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ly6fP35460 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ly6fP35460 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ly6fP35460 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ly6fP35460 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ly6fP35460 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ly6fP35460 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ly6fP35460 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ly6fP35460 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ly6fP35460 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ly6fP35460 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ly6fP35460 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ly6fP35460 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ly6fP35460 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ly6fP35460 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ly6fP35460 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ly6fP35460 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ly6fP35460 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ly6fP35460 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ly6fP35460 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ly6fP35460 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ly6fP35460 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ly6fP35460 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms