Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp4P35123 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp4P35123 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp4P35123 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp4P35123 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp4P35123 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp4P35123 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp4P35123 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp4P35123 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp4P35123 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp4P35123 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp4P35123 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp4P35123 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp4P35123 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp4P35123 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp4P35123 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp4P35123 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp4P35123 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp4P35123 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp4P35123 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp4P35123 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp4P35123 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp4P35123 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp4P35123 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp4P35123 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp4P35123 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp4P35123 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp4P35123 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp4P35123 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp4P35123 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp4P35123 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp4P35123 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp4P35123 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp4P35123 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp4P35123 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp4P35123 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp4P35123 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp4P35123 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp4P35123 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp4P35123 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp4P35123 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp4P35123 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp4P35123 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp4P35123 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp4P35123 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp4P35123 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp4P35123 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp4P35123 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp4P35123 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp4P35123 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp4P35123 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp4P35123 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp4P35123 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp4P35123 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp4P35123 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp4P35123 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp4P35123 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp4P35123 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp4P35123 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp4P35123 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp4P35123 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp4P35123 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp4P35123 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp4P35123 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp4P35123 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp4P35123 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp4P35123 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp4P35123 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp4P35123 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp4P35123 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp4P35123 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp4P35123 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp4P35123 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp4P35123 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp4P35123 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp4P35123 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp4P35123 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp4P35123 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp4P35123 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp4P35123 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp4P35123 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp4P35123 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp4P35123 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp4P35123 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp4P35123 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp4P35123 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp4P35123 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp4P35123 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp4P35123 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp4P35123 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp4P35123 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp4P35123 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp4P35123 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp4P35123 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp4P35123 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp4P35123 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp4P35123 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp4P35123 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp4P35123 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp4P35123 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms