Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Apoc1P34928 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Apoc1P34928 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Apoc1P34928 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apoc1P34928 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Apoc1P34928 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apoc1P34928 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Apoc1P34928 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apoc1P34928 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Apoc1P34928 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apoc1P34928 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apoc1P34928 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apoc1P34928 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Apoc1P34928 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apoc1P34928 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Apoc1P34928 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apoc1P34928 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apoc1P34928 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apoc1P34928 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Apoc1P34928 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apoc1P34928 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apoc1P34928 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Apoc1P34928 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apoc1P34928 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apoc1P34928 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apoc1P34928 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apoc1P34928 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apoc1P34928 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Apoc1P34928 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Apoc1P34928 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apoc1P34928 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apoc1P34928 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Apoc1P34928 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Apoc1P34928 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apoc1P34928 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Apoc1P34928 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apoc1P34928 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apoc1P34928 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apoc1P34928 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apoc1P34928 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apoc1P34928 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apoc1P34928 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apoc1P34928 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apoc1P34928 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Apoc1P34928 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apoc1P34928 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apoc1P34928 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apoc1P34928 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Apoc1P34928 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apoc1P34928 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apoc1P34928 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apoc1P34928 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apoc1P34928 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apoc1P34928 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apoc1P34928 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apoc1P34928 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apoc1P34928 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Apoc1P34928 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apoc1P34928 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apoc1P34928 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apoc1P34928 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Apoc1P34928 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Apoc1P34928 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Apoc1P34928 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Apoc1P34928 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Apoc1P34928 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Apoc1P34928 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Apoc1P34928 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Apoc1P34928 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Apoc1P34928 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Apoc1P34928 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Apoc1P34928 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Apoc1P34928 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Apoc1P34928 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Apoc1P34928 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Apoc1P34928 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Apoc1P34928 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Apoc1P34928 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Apoc1P34928 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apoc1P34928 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apoc1P34928 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apoc1P34928 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apoc1P34928 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apoc1P34928 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apoc1P34928 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apoc1P34928 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Apoc1P34928 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Apoc1P34928 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apoc1P34928 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apoc1P34928 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Apoc1P34928 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apoc1P34928 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apoc1P34928 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apoc1P34928 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apoc1P34928 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apoc1P34928 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apoc1P34928 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apoc1P34928 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apoc1P34928 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Apoc1P34928 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms