Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms