Protein–RNA interactions for Protein: P28862

Mmp3, Stromelysin-1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp3P28862 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mmp3P28862 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mmp3P28862 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mmp3P28862 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mmp3P28862 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mmp3P28862 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mmp3P28862 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mmp3P28862 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mmp3P28862 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Mmp3P28862 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mmp3P28862 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mmp3P28862 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Mmp3P28862 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mmp3P28862 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mmp3P28862 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mmp3P28862 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mmp3P28862 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mmp3P28862 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mmp3P28862 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mmp3P28862 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mmp3P28862 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Mmp3P28862 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mmp3P28862 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mmp3P28862 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mmp3P28862 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mmp3P28862 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mmp3P28862 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mmp3P28862 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mmp3P28862 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mmp3P28862 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mmp3P28862 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mmp3P28862 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mmp3P28862 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mmp3P28862 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mmp3P28862 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mmp3P28862 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mmp3P28862 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mmp3P28862 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Mmp3P28862 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mmp3P28862 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mmp3P28862 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mmp3P28862 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Mmp3P28862 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mmp3P28862 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mmp3P28862 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mmp3P28862 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mmp3P28862 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mmp3P28862 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mmp3P28862 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mmp3P28862 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mmp3P28862 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mmp3P28862 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mmp3P28862 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mmp3P28862 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mmp3P28862 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Mmp3P28862 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mmp3P28862 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mmp3P28862 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mmp3P28862 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mmp3P28862 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mmp3P28862 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mmp3P28862 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mmp3P28862 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mmp3P28862 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mmp3P28862 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mmp3P28862 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mmp3P28862 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mmp3P28862 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mmp3P28862 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mmp3P28862 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mmp3P28862 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mmp3P28862 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mmp3P28862 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mmp3P28862 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mmp3P28862 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mmp3P28862 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mmp3P28862 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mmp3P28862 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mmp3P28862 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mmp3P28862 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mmp3P28862 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mmp3P28862 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mmp3P28862 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mmp3P28862 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mmp3P28862 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mmp3P28862 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mmp3P28862 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mmp3P28862 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mmp3P28862 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mmp3P28862 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mmp3P28862 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mmp3P28862 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mmp3P28862 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mmp3P28862 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mmp3P28862 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mmp3P28862 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mmp3P28862 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mmp3P28862 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mmp3P28862 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mmp3P28862 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms