Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CftrP26361 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CftrP26361 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CftrP26361 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CftrP26361 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CftrP26361 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CftrP26361 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
CftrP26361 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CftrP26361 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
CftrP26361 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CftrP26361 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
CftrP26361 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CftrP26361 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CftrP26361 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CftrP26361 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CftrP26361 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
CftrP26361 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CftrP26361 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CftrP26361 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CftrP26361 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CftrP26361 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CftrP26361 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CftrP26361 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CftrP26361 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CftrP26361 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
CftrP26361 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
CftrP26361 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CftrP26361 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
CftrP26361 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CftrP26361 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CftrP26361 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CftrP26361 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CftrP26361 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CftrP26361 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CftrP26361 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CftrP26361 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CftrP26361 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CftrP26361 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CftrP26361 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CftrP26361 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CftrP26361 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CftrP26361 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CftrP26361 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CftrP26361 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CftrP26361 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CftrP26361 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CftrP26361 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CftrP26361 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
CftrP26361 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CftrP26361 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
CftrP26361 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CftrP26361 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CftrP26361 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CftrP26361 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CftrP26361 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CftrP26361 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CftrP26361 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CftrP26361 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CftrP26361 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CftrP26361 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CftrP26361 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
CftrP26361 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CftrP26361 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CftrP26361 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CftrP26361 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
CftrP26361 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CftrP26361 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
CftrP26361 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
CftrP26361 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
CftrP26361 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CftrP26361 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CftrP26361 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CftrP26361 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CftrP26361 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CftrP26361 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CftrP26361 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CftrP26361 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
CftrP26361 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CftrP26361 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CftrP26361 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CftrP26361 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CftrP26361 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CftrP26361 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CftrP26361 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CftrP26361 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CftrP26361 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CftrP26361 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CftrP26361 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CftrP26361 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CftrP26361 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CftrP26361 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CftrP26361 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CftrP26361 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CftrP26361 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CftrP26361 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CftrP26361 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CftrP26361 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CftrP26361 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CftrP26361 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CftrP26361 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms