Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms