Protein–RNA interactions for Protein: P25425

Pou2f1, POU domain, class 2, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou2f1P25425 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pou2f1P25425 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pou2f1P25425 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pou2f1P25425 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pou2f1P25425 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pou2f1P25425 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pou2f1P25425 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pou2f1P25425 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pou2f1P25425 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pou2f1P25425 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pou2f1P25425 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou2f1P25425 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou2f1P25425 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou2f1P25425 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou2f1P25425 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou2f1P25425 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou2f1P25425 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou2f1P25425 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou2f1P25425 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou2f1P25425 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou2f1P25425 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou2f1P25425 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou2f1P25425 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou2f1P25425 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou2f1P25425 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou2f1P25425 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou2f1P25425 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou2f1P25425 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou2f1P25425 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou2f1P25425 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou2f1P25425 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou2f1P25425 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou2f1P25425 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou2f1P25425 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou2f1P25425 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou2f1P25425 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou2f1P25425 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou2f1P25425 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou2f1P25425 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou2f1P25425 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou2f1P25425 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou2f1P25425 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou2f1P25425 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou2f1P25425 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou2f1P25425 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou2f1P25425 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou2f1P25425 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou2f1P25425 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou2f1P25425 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou2f1P25425 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou2f1P25425 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou2f1P25425 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou2f1P25425 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou2f1P25425 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou2f1P25425 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou2f1P25425 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou2f1P25425 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou2f1P25425 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou2f1P25425 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou2f1P25425 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou2f1P25425 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou2f1P25425 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou2f1P25425 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou2f1P25425 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou2f1P25425 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou2f1P25425 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou2f1P25425 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou2f1P25425 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou2f1P25425 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou2f1P25425 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou2f1P25425 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou2f1P25425 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou2f1P25425 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou2f1P25425 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou2f1P25425 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou2f1P25425 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou2f1P25425 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou2f1P25425 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms