Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Nppb-201ENSMUST00000103231 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxd11P23813 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxd11P23813 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxd11P23813 Tmsb15l-201ENSMUST00000127404 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxd11P23813 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxd11P23813 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxd11P23813 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxd11P23813 Gm22143-201ENSMUST00000157401 203 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxd11P23813 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxd11P23813 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxd11P23813 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxd11P23813 Gm37005-201ENSMUST00000193281 1164 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxd11P23813 Gm37473-201ENSMUST00000195079 674 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxd11P23813 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxd11P23813 Olfr46-202ENSMUST00000211771 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxd11P23813 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxd11P23813 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxd11P23813 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxd11P23813 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxd11P23813 Gm28649-201ENSMUST00000189153 1581 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxd11P23813 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxd11P23813 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxd11P23813 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxd11P23813 Gm3563-201ENSMUST00000172963 1628 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxd11P23813 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxd11P23813 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxd11P23813 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxd11P23813 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxd11P23813 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxd11P23813 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxd11P23813 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxd11P23813 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxd11P23813 Gm37934-201ENSMUST00000192902 402 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxd11P23813 Hmgb1-ps11-201ENSMUST00000221749 621 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxd11P23813 AC160114.3-201ENSMUST00000222256 560 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxd11P23813 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxd11P23813 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxd11P23813 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxd11P23813 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxd11P23813 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxd11P23813 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxd11P23813 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxd11P23813 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxd11P23813 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxd11P23813 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxd11P23813 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxd11P23813 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxd11P23813 Gm14253-201ENSMUST00000122112 639 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxd11P23813 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxd11P23813 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxd11P23813 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxd11P23813 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxd11P23813 1700125H20Rik-201ENSMUST00000018623 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxd11P23813 AC102352.1-201ENSMUST00000224187 582 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxd11P23813 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 Gm45885-202ENSMUST00000211520 1383 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 Mir669p-2-201ENSMUST00000103868 87 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 Mir669p-1-201ENSMUST00000103884 87 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 2010106E10Rik-202ENSMUST00000113412 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 Gm14908-201ENSMUST00000120930 1286 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 Gm35202-201ENSMUST00000130083 712 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 Gm8582-201ENSMUST00000164061 789 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 Gm28083-201ENSMUST00000186533 538 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 9530018H14Rik-201ENSMUST00000192253 1243 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 4930533L02Rik-201ENSMUST00000194425 1160 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 Rrh-205ENSMUST00000196902 1250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 AC154594.1-201ENSMUST00000225171 1273 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 A330043C09Rik-201ENSMUST00000139823 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 9430092D12Rik-201ENSMUST00000194937 1274 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 Gm18150-201ENSMUST00000195341 645 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 Gm5885-202ENSMUST00000203357 528 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 Gm45299-202ENSMUST00000211011 765 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 Gm45240-201ENSMUST00000211437 674 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 Rpl31-201ENSMUST00000086535 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 Gm42905-201ENSMUST00000196237 1611 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms