Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ggta1P23336 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ggta1P23336 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ggta1P23336 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ggta1P23336 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ggta1P23336 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ggta1P23336 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ggta1P23336 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ggta1P23336 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ggta1P23336 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ggta1P23336 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ggta1P23336 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ggta1P23336 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ggta1P23336 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ggta1P23336 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ggta1P23336 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ggta1P23336 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ggta1P23336 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ggta1P23336 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ggta1P23336 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ggta1P23336 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ggta1P23336 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ggta1P23336 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ggta1P23336 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ggta1P23336 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ggta1P23336 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ggta1P23336 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ggta1P23336 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ggta1P23336 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ggta1P23336 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ggta1P23336 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ggta1P23336 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ggta1P23336 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ggta1P23336 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ggta1P23336 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ggta1P23336 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ggta1P23336 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ggta1P23336 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ggta1P23336 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ggta1P23336 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ggta1P23336 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ggta1P23336 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ggta1P23336 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ggta1P23336 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ggta1P23336 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ggta1P23336 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ggta1P23336 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ggta1P23336 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ggta1P23336 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms