Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrkchP23298 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PrkchP23298 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PrkchP23298 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PrkchP23298 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PrkchP23298 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
PrkchP23298 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkchP23298 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkchP23298 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkchP23298 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkchP23298 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkchP23298 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkchP23298 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkchP23298 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkchP23298 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkchP23298 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkchP23298 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkchP23298 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkchP23298 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkchP23298 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkchP23298 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkchP23298 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkchP23298 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkchP23298 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkchP23298 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkchP23298 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkchP23298 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PrkchP23298 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PrkchP23298 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PrkchP23298 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PrkchP23298 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PrkchP23298 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PrkchP23298 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PrkchP23298 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PrkchP23298 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
PrkchP23298 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PrkchP23298 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PrkchP23298 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PrkchP23298 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PrkchP23298 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PrkchP23298 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PrkchP23298 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PrkchP23298 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PrkchP23298 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkchP23298 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkchP23298 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkchP23298 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkchP23298 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkchP23298 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkchP23298 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkchP23298 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms